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近几个月来,omicron (B.1.1.529) 已成为严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 的主要变种,显示出一定程度的免疫逃避。1 omicron 的主要子变体 BA.1 和 BA.2 在许多国家正逐渐被 BA.5 取代,这可能是由于 BA.1 和 BA.2 引起的传播性增加和部分免疫逃避。2,3 BA.1 提供的针对 BA.5 子变量感染的保护至关重要,因为临床试验中的适应疫苗基于 BA.1。
葡萄牙是最早受到 BA.5 支配地位影响的国家之一。 我们使用 2019 年冠状病毒疾病国家登记处 (Covid-19) (SINAVE) 来计算记录感染先前变体(包括 BA.1 和 BA.2)的受试者感染 BA.5 的风险。 登记处包括该国报告的所有病例,无论临床表现如何。
如面板 (a) 所示,我们确定了超过 90% 的样本分离株(数据来自国家严重急性呼吸综合征冠状病毒 2)中存在单一变体的时期(以不同的颜色)。 [SARS-CoV-2] 遗传多样性控制4)。 灰色的时期代表不止一个变量在循环中的时间。 鉴于 omicron BA.1 变体的优势与 omicron BA.2 变体的优势之间的过渡相对缓慢,我们在分析中合并了 BA.1 和 BA.2。 我们没有包括在 omicron BA.5 亚因子优势之前 90 天内感染的任何受试者。 图 B 显示了在 BA.5 控制期(从 2022 年 6 月 1 日起)中,在不同变体的显着期(如图 A 中所示)与没有记录的受试者相比,在不同变体的优势期中具有单一感染的受试者对感染的保护效果6月1日感染。 该研究不包括在 6 月 1 日之前感染的人。 𝙸 条形代表 95% 的置信区间。
国家对 SARS-CoV-2 的基因监测已经确定了不同变异体占分离株 90% 以上的时期。4 我们针对每个变量确定了在控制期内首次感染的所有受试者,以计算他们在 BA.5 控制期的感染风险(图 1a)。 由于总体中两个子变量之间的过渡缓慢,我们汇总了 BA.1 和 BA.2。 最后,我们计算了在 BA.5 优势(2022 年 6 月 1 日)之前没有记录感染的人群的 BA.5 风险。
我们发现以前的 SARS-CoV-2 感染对 BA.5 感染具有保护作用(图 1b 和补充附录中的表 S1,可在 NEJM.org 上与本信函的全文一起获得),这种保护对于既往感染 BA.1 或 BA.2 是最大的。 鉴于葡萄牙 98% 以上的研究人群在 2022 年之前完成了主要疫苗接种系列,因此必须在高度接种疫苗人群的外显率感染情况下考虑这些数据。
研究设计不能消除所有混杂因素(见补充附录中的讨论部分)。 此外,一个限制是在具有杂合免疫(先前感染和接种疫苗)的人群中免疫力降低的推定效应。 我们发现,接种疫苗的受试者中的 BA.1 或 BA.2 感染比感染前微米变体提供了更高的针对 BA.5 的保护,这与最近关于阴性测试设计的报告一致。5 然而,BA.1 或 BA.2 感染发生在更接近 BA.5 优势时期的情况下,而不是早期变体的感染。 鉴于以前感染 BA.1 或 BA.2 病毒的人中大量感染 BA.5,人们认为以前感染 BA.1 或 BA.2 所提供的保护非常低。 我们的数据表明,与其他子变量的感染相比,这种看法可能是更多的 BA.1 或 BA.2 感染受试者的结果,并且没有数据支持。
总体而言,我们发现在高度接种疫苗的人群中,特别是对于既往 BA.1 或 BA.2 感染的人群,与未感染的受试者相比,BA.5 变体穿透性感染的可能性较小… .
若昂·马拉托,MA。
Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes,里斯本,葡萄牙
罗伊 M.里贝罗,菲尔 D.
洛斯阿拉莫斯国家实验室,新墨西哥州洛斯阿拉莫斯
Pedro P. Leite,医学博士
佩德罗·卡萨卡,医学博士
Eugenia Fernandez,博士
Direção Geral da Saúde,里斯本,葡萄牙
Carlos Antunes 博士
里斯本大学,里斯本,葡萄牙
Válter R. Fonseca,医学博士,博士
Direção Geral da Saúde,里斯本,葡萄牙
Manuel C. Gomez 博士
里斯本大学,里斯本,葡萄牙
Luis Graca,医学博士,Phil D.
Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes,里斯本,葡萄牙
[email protected]
在欧盟的支持下
作者提供的披露表与本函全文可在 NEJM.org 上获取。
此消息于 2022 年 8 月 31 日发布于 NEJM.org。
博士.. Gomez 和 Graca 对这一信息做出了同样的贡献。
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1. cho b和 瓦罗尼和 埃文斯 JB, 和别的。 中和 SARS-CoV-2 omicron 子变体 BA.4/5 和 BA.2.12.1。 在天使医学杂志 2022; 386:2526–2528.
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2. 哟和 矿工A和 只读存储器, 和别的。 中和 SARS-CoV-2 omicron 变体 BA.1 和 BA.2。 在天使医学杂志 2022; 386:1579–1580.
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3. 曹伟和 依斯麦和 简飞, 和别的。 由 omicron 感染 BA.2.12.1、BA.4 和 BA.5 引起的抗体。 脾气本性 2022; 608:593–602.
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4. Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge。 葡萄牙新型冠状病毒 SARS-CoV-2 (COVID-19) 的遗传多样性。 (在葡萄牙语) 2022 (https://insaflu.insa.pt/covid19)。
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5. 塔劳内和 基米特利 H和 阿尤布·斯穆, 和别的。 使用 omicron BA.4 或 BA.5 子变体防止自然 SARS-CoV-2 感染免受再感染。 七月 12和 2022 (https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2022.07.11.22277448v1)。 预印本。
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